中国海洋大学三亚海洋研究院成立于2019年5月，是海南省、中国海洋大学、三亚市三家共建的新型事业单位（独立法人），是学校建设特色显著的世界一流大学的重要组成部分，是学校推动海洋科技实现高水平自立自强的深海前沿阵地，是学校创新发展的试验田和示范区。2022年4月10日，习近平总书记考察了中国海洋大学三亚海洋研究院，了解海洋观测设备与信息服务系统研发应用情况，并发表重要讲话。研究院紧密围绕“深海”和“南繁（水产）”，深化科学研究、人才培养和产业技术研发融合发展，打造推动海洋科技实现高水平自立自强的深海前沿阵地。强化学科深度融合，组建了热带海洋生物种质资源开发与种业工程和深海立体观测与信息服务两个交叉融合的大创新团队，集聚院士、长江学者、杰青、“万人计划”等100余名高水平科研人员，常驻海南开展原创性引领性科技攻关，强化国家战略科技力量；深化产教融合科教融汇，构建学科深度交叉的深远海创新人才培养模式，累计招收海南专项研究生1243名，培养国家急需海洋高层次人才；构建协同发展共同体，组建热带水产种业、热带海洋生物资源、海洋功能材料与防护技术、海洋信息等4大技术创新中心，强化海洋科技创新驱动，服务区域经济社会发展。

中国海洋大学三亚海洋研究院知识产权布局领域主要集中于水产养殖、深海科技等领域，目前专利申请近117项，有效发明专利29项，软件著作权15项。此外，还连续入榜了崖州湾科技城第二届和第三届“知识产权创造力TOP30”榜单。